معنای بالینی AFP یا آلفا فتوپروتئین بستگی به زمینه ای دارد که در آن اندازه گیری می شود. در اینجا برخی از معانی اصلی بالینی AFP آورده شده است:
1. تشخیص محتوای AFP سرم در کودکان: افزایش محتوای AFP در سرطان کبد، هپاتوبلاستوم، اوبلاستوم گناد، هپاتیت و غیره.
2. تشخیص محتوای AFP سرم در بزرگسالان: محتوای AFP در 60 تا 70 درصد بیماران مبتلا به سرطان اولیه کبد و همچنین در بیماران مبتلا به سرطان بیضه، تومور تخمدان، تراتوم بدخیم، سرطان پانکراس، سرطان معده، سرطان روده و سرطان ریه.
3. در بیماران مبتلا به بیماری های کبدی خوش خیم مانند هپاتیت حاد و مزمن و سیروز، سطح AFP سرم به درجات مختلف افزایش یافت، اما بیشتر آنها کمتر از 1000 میکروگرم در لیتر بود که با درجه نکروز و بازسازی سلول های کبدی مرتبط بود.
4. افزایش AFP در بیماری های خوش خیم کبد گذرا است و به مدت 2-3 هفته ادامه دارد. تومورهای بدخیم به طور مداوم افزایش می یابد. بنابراین، مشاهده پویا محتوای AFP سرم نه تنها می تواند بیماری خوش خیم کبد را از بیماری بدخیم کبد متمایز کند، بلکه سرطان کبد را در مراحل اولیه تشخیص می دهد.
5. تحت شرایط فیزیولوژیکی، آلفا فتوپروتئین توسط سلولهای کبدی ساده متولد شده ترشح می شود، در حالی که سلولهای کبدی جنین به طور کامل توسعه نیافته اند (متمایز شده). مقدار آلفا فتوپروتئین ترشح شده زیاد است که می تواند از طریق خون بند ناف وارد خون مادر شود، بنابراین زنان باردار در دوران بارداری از نظر آلفا فتوپروتئین مثبت خواهند بود.